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全长16S / 18S二代测序
◈产品介绍
基于二代测序技术手段，进行基因组组装和基本分析，获得高质量基因组序列。为该物种的后基因组学研究奠定基础。
简单基因组：
CONTIG N50≥200KB，复杂基因组（小于2G）：contig N50≥100Kb。
简单基因组6个月，复杂基因组视根据具体情况而定。
◈分析内容
标准信息分析
①下机数据过滤；
②基因组组装；
③全基因组精细注释：编码基因预测；重复序列注释和转座元件分类；Non-coding RNA注释；假基因注释；
④基因功能注释：Nr库注释；KEGG代谢通路注释；
COG注释（Gene Ontology）；TrEMBL注释；调控Motif预测。
◈高级信息分析
①基因家族聚类，特有、共有基因和基因家族统计；
②基因家族扩张收缩分析；
③系统发育树的构建；
④物种分化时间推算（需要化石标定）；
⑤LTR形成时间估算；
⑥全基因组复制事件（一般为植物基因组的分析项）；
⑦选择压力分析。
全长16S / 18S三代测序
◈产品介绍
在已知基因组的大小难度，或者有调研图结果的情况下，基于三代测序PacBio技术手段，进行基因组组装和基本分析，获得高质量基因组序列。为该物种的后基因组学研究奠定基础。
简单基因组：CONTIG N50≥2MB，复杂基因组：contig N50≥1Mb
一步到位检测环境微生物多样性
16S/18S 等全长扩增子测序即通过提取环境样品的 DNA，选择合适的通用引物扩增 16S/18S 的全长区域。
全长16S测序：细菌群落结构多样性。
全长18S测序：真核微生物群落结构多样性。
◈分析内容
标准信息分析
①下机数据过滤；
②基因组组装；
③全基因组精细注释：编码基因预测；重复序列注释和转座元件分类；Non-coding RNA注释；假基因注释；
④基因功能注释：Nr库注释；KEGG代谢通路注释；COG注释（Gene Ontology）；TrEMBL注释；调控Motif预测；
高级信息分析
①基因家族聚类，特有、共有基因和基因家族统计；
②基因家族扩张收缩分析；
③系统发育树的构建；
④物种分化时间推算（需要化石标定）；
⑤LTR形成时间估算；
⑥全基因组复制事件（一般为植物基因组的分析项）；
⑦选择压力分析。
◈服务流程
◈产品优势
长度长，周期短，性价比高
采用 PacBio 平台，长度长，一次可分析多个高变区信息，不仅能提高物种鉴定的分辨率，还能提高物种鉴定的精确度。更加真实的还原样本中微生物的群落结构。
公司还拥有二代测序仪，三代测序仪（RS II 和sequel），光学图谱Irys，Hi-C组装技术等。
拥有自主研发的领先的基因组测序和分析技术。
◈信息分析
基于测序得到的序列，进行 OUT 聚类和物种注释分析，获得物种的丰度分布。全面分析样本内物种的丰富度及组间的差异。
标准分析 | 解决问题 |
物种注释 | 物种注释及各物种丰度信息 |
α-多样性分析 | 微生物群落的丰富度和多样性 |
β-多样性分析 | 不同样本间的微生物群落 |
多元统计分析 | 寻找组间具有显著差异的物种，同时可以比较组内差异和组间差异的大小，判断分组是否有意义 |
CCA分析 | 研究物种组成与环境因子间的关系 |
环境因子关联分析 | |
VPA分析 |
宏基因测序
宏基因组学（Metagenomics），又称元基因组学，是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象，无需分离培养，直接提取环境样本DNA进行测序，研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等，已广泛应用于微生物领域。
◈适用范围
1. 环境领域：雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境等；
2. 生物能源：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发；
3. 医学领域：代谢病、肿瘤癌症等；
4. 农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等；
5. 畜牧领域：肠道、瘤胃（如产甲烷菌类群）与动物健康/营养消化研究等；
6. 特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究。
◈实验流程
◈样品要求：
送样要求 | 环境样本：土壤：3g；粪便：200mg ；污泥/沉积物：3 g；血液：2 mL；液体：25mL。 |
平台选择 | Illumina PE100/125/150 |
推荐测序量 | 肠道/粪便 >6G；水体6-8G；土壤/污泥 > 8G |
◈生信分析：
