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靶向代谢组
◈靶向代谢组学概述
靶向代谢组学(Targeted metabolomics):针对几种目标化合物或某条通路上涉及的全部或部分代谢物,利用标准品,构建特异性强、灵敏度高、重复性好的检测方法,对目标化合物进行定量与分析。
我们可同时对中心碳代谢的多个通路中共220种代谢物进行靶向检测,还可针对胆汁酸代谢、氨基酸代谢、内源性大麻素类、神经递质类、维生素类、卡尼汀类、植物次生代谢产物以及短链脂肪酸类等进行靶向检测。
◈靶向代谢组学实验流程
基于 LC-MS/GC-MS 技术,采用目标化合物标准品进行方法优化、方法验证、生物样本收集、代谢物提取、质谱检测、数据分析等。
◈靶向代谢化合物检测列表
◈应用方向
短链脂肪酸
具有调节血糖、抗炎、改善肠道功能的作用。
氨基酸
与人的心血管疾病、糖尿病相关与植物的生长发育、抗逆、衰老过程相关。
脂肪酸
是细胞膜主要成分,具有抑菌、调节肠道菌群结构等功能,与多种疾病相关。
中心碳相关物质
动植物生命活动的物质基础,与动植物的成长发育过程密切相关。
TMAO及其他相关物质
存在于水产、哺乳动物、植物、真菌中,与心血管疾病、心肌梗死、糖尿病相关。
神经递质
充当“信使”的特定化学物质,与多种神经系统病相关。
胆汁酸
存在于人和动物胆汁、粪便、血液中,与肝胆疾病(肝炎、肝硬化)、肠胃疾病(胃溃疡)相关。
◈可分析样本类型
植物组织、动物组织、血清、血浆、尿液、细胞、微生物、粪便、唾液、脑嵴液、发酵液、橄榄油、胃液、其他
非靶向代谢组检测
◈非靶向代谢组学概述
非靶向代谢组学(Untargeted metabolomics)是指采用 LC-MS、GC-MS、NMR技术,无偏向性的检测细胞、组织、器官或 者生物体内受到刺激或扰动前后所有小分子代谢物(主要是相对分子量1000 Da以内的内源性小分子化合物) 的动态变化,并通过生信分析筛选差异代谢物,对差异代谢物进行通路分析,揭示其变化的生理机制。
◈方法流程
代谢组学研究实验流程可分为样本采集及前处理、代谢物提取及浓缩、 上机检测以及数据分析,进而揭示其生命机制。美序生物对每一个实验步骤都严格把控, 实现标准化操作,从根本上确保高质量数据的产出。
◈美序生物的优势
◈应用领域
◈分析类型
肠道菌群代谢全谱分析
植物代谢组学分析
胆汁酸全谱分析
医学代谢组学分析
药物代谢组学
细胞代谢组学分析
微生物代谢组学分析
◈样本要求
样本类型及需求量:
血清、血浆 ≥ 0.25ml、血清、血浆 ≥ 0.25ml、尿液 ≥ 0.25ml、粪便 ≥ 0.5g、动物组织 ≥ 0.5g、植物组织 ≥ 1g、细胞 ≥ 107个、微生物 ≥ 0.25g。
生物学重复:临床样本 n ≥ 30、动物样本 n ≥ 8、植物和微生物样本 n ≥ 6。
脂质组学
◈脂质组学概念
脂质是一类疏水性或两性小分子。脂质组学(Lipidomics)是一种基于高通量分析技术,系统性解析生物体脂质组成与表达变化的研究模式。脂质组学分析,可以高效地研究脂类家族、脂质分子在各种生物过程中的改变与功能,进而阐明相关的生物活动机制与原理。
◈脂质大体分为八大类:
1.脂肪酸类(fatty acids)
2.甘油脂类(glycerolipids)
3.甘油磷脂类(glycerophospholipids)
4.鞘脂类 (sphingolipids)
5.固醇脂类(sterol lipids)
6.孕烯醇酮脂类(prenol lipids)
7.糖脂类(saccharolipids)
8.多聚乙烯类(polyketides)
◈脂质组学应用及美序优势
脂质结构的多样性赋予了脂质多种重要的生物功能,脂质分子是生物膜的必需组分,另外脂质还是生物体血液中含量最高的组分,作为生物体能量平衡的重要组成部分,脂质自身也是重要的信号分子,广泛地参与细胞间、细胞内的信号转导。脂质异常代谢也是引发人类健康的心脑血管疾病、恶性肿瘤、神经体系疾病和代谢紊乱疾病等的重要因素。
我公司采用高通量测试分析平台一次定性脂质1000种左右,并且利用先进的生物信息分析软件对这些脂质分子功能进行深入分析,为阐明脂质小分子的功能提供科学指导。同时我公司基于自身仪器平台开发了标准品数据库内含标准品500余种,同时公司还具备化学合成部,对于市面上买不到的标准品进行合成,为标志物的定性提供强有力的标准品支持。